Хедрик Ф. «Генетика популяций» 2003 год
Автор: Хедрик Ф.
Год: 2003
Монография рассчитана на специалистов-биологов различных областей, в том числе студентов. В книге доступно изложены основные принципы современной генетики и теории эволюции.
Помимо известных фактов, приводятся и новые данные, полученные с помощью современных молекулярно-генетических методов. Расширен и диапазон объектов исследования - от классической дрозофилы до человека.
Каждая глава завершается оригинальными задачами и упражнениями, помогающими усвоить материал и получить практические навыки постановки экспериментов.
Приведенные примеры хорошо иллюстрированы графиками, таблицами, фотографиями. Во всех главах использован доступный любому студенту математический аппарат, что способствует развитию навыков статистической обработки наблюдений.
Несомненно, книга заинтересует как профессионалов в области генетики, так и тех, кто только приступает к освоению азов этой науки.
Предисловие
Глава 1. Общий фон и многообразие генетической изменчивости
I. Методы исследования в популяционной генетике
II. Понятие о генетических терминах
a. Некоторые генетические термины
b. Генетический код
c. Структура генома и типичный эукариотический ген
III. Введение в количественные методы
а. Модели
b. Средние, вариансы и доверительные интервалы
c. Вероятность
d. Матрицы
IV. Генетическая изменчивость
a. Изменчивость аллоферментов
b. Нуклеотидная и аминокислотная изменчивость
c. Видимый полиморфизм
d. Мутации, летальные аллели и модификаторы приспособленности
e. Полигенные, или количественные, признаки
Задачи
Глава 2. Количественная оценка генетической изменчивости
I. Закон Харди-Вайнберга
II. Межполовые различия по частоте аллелей
a. Аутосомные гены
b. Х-сцепленные гены или гены гапло-диплоидов
III. Оценки аллельной частоты
IV. Проверка закона Харди-Вайнберга
V. Измерение генетической изменчивости
a. Гетерозиготность
b. Доля полиморфных локусов и другие величины
VI. Оценка разнообразия нуклеотидного и аминокислотного состава
VII. Измерение генетического расстояния
Задачи
Глава 3. Понятие об отборе
I. Основная модель отбора
a. Рецессивные летали
b. Отбор против рецессивов
c. Промежуточное доминирование (аддитивность) и отбор против гамет или против гаплоидов
d . Отбор против доминант
e. Общее доминирование
f. Преимущество гетерозигот
g. Невыгодность гетерозигот
II. Развитие некоторых генетических положений
а. Х-сцепленные гены или гены гапло-диплоидных организмов
Ь. Множественные аллели
Задачи
Глава 4. Отбор: другие модели и оценки
I. Компоненты приспособленности
II. Отбор на жизнеспособность
a. Различия в жизнеспособности на разных стадиях жизненного цикла
b. Межполовые различия в жизнеспособности
III. Половой отбор
a. Негативно-ассортативное скрещивание
b. Преимущество скрещиваний с самцами редкого типа
IV. Отбор гамет
a. Мейотический дрейф
b. Аллели самонесовместимости
V. Оценка отбора
a. Отбор на жизнеспособность
b. Совершенный отбор
c. Частоты генотипов
VI. Экологическая генетика и балансирующий отбор
a. Пространственная изменчивость
b. Изменчивость приспособленности во времени
c. Частотно-зависимый отбор
Задачи
Глава 5. Инбридинг и связанные с ним вопросы
I. Инбридинг
a. Самооплодотворение
b. Частичное самооплодотворение
c. Оценки перекрестного оплодотворения и самооплодотворения
d. Регулярные системы инбридинга
e. Другие уровни частичного инбридинга
f. Оценка инбридинга из родословных
g. Метод расчета цепи
h. Инбридинг в природных популяциях животных
II. Инбридинг и отбор
a. Инбредная депрессия
b. Изменение частот аллелей и условия для полиморфизма
c. Родственный отбор
III. Бесполое, или апомиксное, размножение
IV. Положительная ассортативность скрещивания
Задачи
Глава 6. Генетический дрейф и эффективный размер популяции
I. Генетический дрейф
a. Метод матрицы вероятностей
b. Эффект основателя и «бутылочного горлышка»
II. Эффективный размер популяции
a. Раздельнополость
b. Вариация числа гамет
c. Инбридинг
d. Изменение численности популяции во времени
e. Возрастная структура
f. Размер соседства
g. Гены митохондрий, хлоропластов и Y хромосом
h. Генетические методы оценки эффективного размера популяции
III. Отбор в ограниченных популяциях
a. Направленный отбор
b. Балансирующий отбор
Задачи
Глава 7. Поток генов и структура популяций
I. Структура популяций
a. Модель материк-остров
b. Обобщенная модель
c. Эффект Воланда
d. Гаметический и зиготический генные потоки
II. Оценка генного потока и структура популяции
a. Популяции гибридов
b. Прямое наблюдение потока генов
c. F-коэффициенты и другие показатели дифференцированной популяции
III. Структура популяции и генетический дрейф
a. Модель материк-остров, или островная модель
b. Лестничная модель
c. Метапопуляция
IV. Генный поток и отбор
a. Модель материк-остров
b. Дифференцирующий отбор и клинья в структурированной популяции
Задачи
Глава 8. Мутации
I. Изменение аллельной частоты под действием мутаций
a. Прямые и обратные мутации
b. Судьба единичных мутаций
II. Баланс мутаций и отбора
a. Рецессивные мутации
b. Доминантные мутации
c. Промежуточное доминирование и груз мутаций
III. Мутации в конечной популяции
a. Нейтральность
b. Отбор
IV. Оценка скорости мутирования
a. Доминантные и кодоминантные мутации
b. Рецессивные мутации
c. Оценка накопления мутаций
d. Факторы, влияющие на скорость мутирования
Задачи
Глава 9. Молекулярная генетика популяций и эволюция
I. Нейтральность и прогнозы молекулярной изменчивости
a. Балансирующий отбор
b. Теория нейтральности
c. Молекулярные часы
d. Коалесценция и генные деревья
II. Доказательства отбора и проверка теории нейтральности
a. Использование кодонов
b. Синонимичные и несинонимичные нуклеотидные замены
c. Тест Эвенса-Ваттерсона
d. Тесты Хадсона-Крайтмана-Агвейда и МакДональда-Крайтмана
e. Тест Таджимы
III. Молекулярная филогенетика
a. Невзвешенный парно-групповой метод (НПГМ)
b. Метод объединения соседей
c. Максимальная экономия
IV. Анализ отцовства и идентификация личности
a. Анализ отцовства
b. Идентификация личности
Задачи
Глава 10. Мультилокусные модели
I. Понятие о гаметическом неравновесии
II. Гаметическое неравновесие и инбридинг, генетический дрейф, генный поток и мутации
a. Инбридинг или репродуктивная система
b. Генетический дрейф
c. Поток генов
d. Мутации
III. Мультилокусный отбор
a. Приспособительный эпистаз
b. Направляющий отбор в двух локусах
c. Основные двухлокусные полиморфизмы
d. Некоторые выводы
IV. Генетический фон и генетический хичхайкинг
V. Рекомбинация и генетическая изменчивость
VI. Оценка гаметического неравновесия
а. Прямая идентификация гамет
b. Два кодоминантных локуса
c. Множественные аллели
Задачи
Глава 11. Количественные признаки и эволюция
I. Природа количественных признаков
a. Общие характеристики
b. Гены, влияющие на количественные признаки
II. Количественная генетическая модель
III. Оценка генетической вариансы и наследуемости
a. Редукция или элиминация одной компоненты вариансы
b. Сходство между родственниками
c. Реализованная наследуемость
d. Факторы, влияющие на генетическую вариансу
IV. Отбор по количественным признакам
a. Отбор в природных популяциях
b. Ответ (реакция) на отбор
c. Оценка отбора в природных популяциях
V. Идентификация локусов количественных признаков (ЛКП)
Задачи